各種editorでmarkdown tableのformatterは用意されていると思いますが、
Atomプラグインのmarkdown-table-editor の出来が非常に良いです。
これまでは、markdown-table-formatter を利用していましたが、こちらよりも数段使いやすいです。
デフォルトだと日本語に対応していないので、以下の「Use East Asian Width」オプションをオンにしておくと良いです。
「Smart Cursor」 の方は、名前から機能が想像できませんが、特定列の修正を連続して行う場合に便利そうです（他にも便利な機能があるのかもしれませんが）。
ご参考
Markdown のテーブルをいい感じに編集する Atom パッケージを作った - Object.create(null)
